гуи - avrdude_prog и сама avrdude , это две разные программы. В Вашем случае лучше воспользоваться avrdude_prog 3.3 и avrdude 5.11. Распакуйте сначала avrdude_prog33, потом в корне программы avrdude_prog 3.3 распакуйте с заменой avrdude 5.11. У проблема какая была такая, есть чипы atmega 64, USBasp...